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海關對進出口貨物報關管理的主要制度實際是報關注冊登記制度，凡是在中華人民共和國進出境口岸辦理進出口貨物報關手續(xù)的企業(yè)必須向海關辦理報關注冊登記進口:　　一、客戶提供到貨通知書、正本提單或電放保函及換單費、THC費等給我司,由我司代客戶到所屬船公司換取進口提貨單。
　　二、準備進口報關所需單證　　1.必備單證：清單 合同一式一份、報關、報檢委托書各一份。
　　2.從歐盟、美國、韓國、日本進口貨物，如是木制包裝箱的需提供熱處理證書或植物檢疫證書，如是非木制的提供無木制包包裝。
　　3.稅則所規(guī)定的各項（如進口許可證 重要工業(yè)品證書）　　4.有減免稅手冊的提供減免稅手冊。
　　三、進口申報后如海關審價需要，客戶需提供相關價格。
如信用證、保單、原廠、招標書等海關所要求的文件。
　　四、海關打印稅單后，客戶需在7個工作日繳納稅費。
如超過期限，海關按日計征滯納金。
　　五、報關查驗放行后，客戶需及時到我司繳納報關、報檢代墊代辦費。
　　※貨物到港后十四日內(nèi)必需向海關申報。
如超過期限海關按日計征滯報金（按貨物價值萬分之五）超過三個月，海關將作無主貨物進行變賣。
進(出)口貨物許可證進出口貨物許可證制度，是對進出口貿(mào)易進行管理的一種行政保護手段。
我國與世界上大多數(shù)國家一樣，也采用這一制度對進出口貨物、物品實行全面管理。
必須向海關交驗進出口貨物許可證的商品并不固定，而是由國家主管部門隨時調(diào)整公布。
凡按國家規(guī)定應申領進出口貨物許可證的商品，報關時都必須交驗由對外貿(mào)易管理部門簽發(fā)的進出口貨物許可證，并經(jīng)海關查驗合格無誤后始能放行。
但對外經(jīng)濟貿(mào)易合作部所屬的進出口公司、經(jīng)國務院批準經(jīng)營進出口業(yè)務的個部位所屬的工貿(mào)公司、個省(直轄市、自治區(qū))所屬的進出口公司，在批準的經(jīng)營范圍內(nèi)進出口商品，視為以取得許可，免領進出口貨物許可證，只憑報關單即可向海關申報;只有在經(jīng)營進出口經(jīng)營范圍以外的商品時才需要交驗許可證。
商檢證書海關指示報關單位出具商檢證書，一方面是監(jiān)督法定檢驗商品是否已經(jīng)接受法定的商檢機構(gòu)檢驗;另一方面是取得進出口商品征稅、免稅、減稅的依據(jù)。
根據(jù)《中華人民共和國進出口商品檢驗法》以及《商檢機構(gòu)實施檢驗的進出口商品種類表》規(guī)定，凡列入《種類表》的法定檢驗的進出口商品，均應在報關前向商品檢驗機構(gòu)報驗。
報關時，對進口商品，海關憑商檢機構(gòu)簽發(fā)的檢驗證書或在進口貨物報關單上加蓋的印章驗收。
除上述單證外，對國家規(guī)定的其他進出口管制貨物，報關單位也必須向海關提交由國家主管部門簽發(fā)的特定的進出口貨物批準單證，由海關查驗合格無誤后再予以放行。
諸如食品衛(wèi)生檢驗，藥品檢驗，動植物檢疫，文物出口簽定，金銀及其制品的管理，珍貴稀有野生動物的管理，進出口射擊運動、狩獵用槍彈和民用爆破物品的管理，進出口音像制品的管理等均屬此列。
(二)進出口貨物的查驗進出口貨物，除海關總署特準查驗的以外，都應接受海關查驗。
查驗的目的是核對報關單證所報內(nèi)容與實際到貨是否相符，有無錯報、漏報、瞞報、偽報等情況，審查貨物的進出口是否合法。
海關查驗貨物，應在海關規(guī)定的時間和場所進行。
如有特殊理由，事先報經(jīng)海關同意，海關可以派人員在規(guī)定的時間和場所以外查詢。
申請人應提供往返交通工具和住宿并支付費用。
海關查驗貨物時，要求貨物的`收、發(fā)貨人或其代理人必須到場，并按海關的要求負責辦理貨物的搬移、拆裝箱和查驗貨物的包裝等工作。
海關認為必要時，可以徑行開驗、復驗或者提取貨樣、貨物保管人應當?shù)綀鲎鳛橐娮C人。
進出口報關的操作流程：　　出口:　　一、出口報關企業(yè)應具備在當?shù)睾ｊP、檢驗檢疫局注冊備案，有進出口經(jīng)營權(quán)和報檢。
　　二、出口報關所需單證：　　1.客戶就在貨物運抵海關區(qū)后，裝貨的之前，備齊海關所需單證向海關申報。
　　2.必備單證：清單合同、核銷單、報關委托書、船公司裝貨單等單各一份。
　　3.按海關稅則所規(guī)定的各項。
(如通關單、出口許可證等)　　4.有出口手冊需提供手冊報關。
　　三、出口報檢所需單證：　　1.客戶應在報關之日天備齊所需單證，向檢驗檢疫局申報。
提供單證有：清單、合同、報檢委托書、廠檢單、紙箱包裝單等各一份。
　　2.出口貨物到美國、澳大利亞、加拿大、歐盟等外包裝為木制的需做熏蒸或熱處理的，客戶所提供的單證有：清單合同、報檢委托書。
如熏蒸產(chǎn)品是木制品，還需提供廠檢單。
　　3.做熏蒸或熱處理的產(chǎn)品，客戶應在報關前兩天，將貨物運抵到的堆場或港區(qū)進行熏蒸。
（熏蒸時間需）　　四、出口報關正式向海關申報。
如出口需繳納稅費的，應及時繳納稅費。
　　五、海關現(xiàn)場審單結(jié)束。
貨物單證放行后，貨主應在海關規(guī)定的時間內(nèi)將貨物運至海關區(qū)內(nèi)進行驗放。
如需查驗，報關行應及時與海關聯(lián)系，進行貨物查驗，驗完后需按船公司封鉛封。
不需查驗的應及時進行實貨放行，將裝貨單按截關時間送到港區(qū)裝船。
　　六、待貨物出口，船公司就將出口艙單數(shù)據(jù)傳送海關，海關接收到數(shù)據(jù)后報關行待海關數(shù)據(jù)結(jié)關后，及時到海關打印退稅核銷聯(lián)。
　　七、出口通關結(jié)束。