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檢測技術(shù)服務(wù):體內(nèi)磷酸化位點(diǎn)鑒定

品牌名稱: 百泰派克生物科技
業(yè)務(wù)范圍: 技術(shù)服務(wù)
經(jīng)營模式: 生產(chǎn)廠商
單價: 面議
發(fā)貨期限: 自買家付款之日起 天內(nèi)發(fā)貨
所在地: 河北 保定
有效期至: 長期有效
發(fā)布時間: 2023-12-14 09:30
最后更新: 2023-12-14 09:30
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檢測技術(shù)服務(wù):體內(nèi)磷酸化位點(diǎn)鑒定--檢測技術(shù)服務(wù)詳情

關(guān)鍵詞:體內(nèi)磷酸化位點(diǎn)鑒定,百泰派克生物科持,生物藥物表征,生物藥物多組學(xué),優(yōu)質(zhì)服務(wù)商,蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué),tmt,抗體測序,itraq,蛋白質(zhì)譜鑒定

體內(nèi)磷酸化的過程就是在激酶的催化作用下,將三磷酸腺苷(ATP)的磷酸根基團(tuán)轉(zhuǎn)移到蛋白的氨基酸側(cè)鏈上,ATP隨之變?yōu)槎姿嵯佘眨ˋDP)。磷酸化修飾可以發(fā)生在多種氨基酸殘基上,主要集中在肽鏈中的酪氨酸、絲氨酸、蘇氨酸殘基上,這些殘基上具有游離的羥基,且本身不帶電荷,當(dāng)磷酸化作用后,蛋白質(zhì)便具有了電荷,從而使結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,進(jìn)一步引起蛋白質(zhì)活性的變化。

體內(nèi)磷酸化位點(diǎn)鑒定主要通過質(zhì)譜法進(jìn)行檢測分析,即通過特定的步驟(如抗體富集、金屬富集和凝集素富集等)獲得富集的修飾肽段,然后進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析。在一次質(zhì)譜鑒定中可以可靠地鑒定數(shù)千種被修飾的多肽。但是對體內(nèi)磷酸化位點(diǎn)的定位識別仍然較為武斷,對于某些修飾位點(diǎn)的鑒定可能并不可靠。質(zhì)譜檢測所得出的實際質(zhì)譜圖在處理過程中需要考慮的因素更為復(fù)雜,如質(zhì)譜中的噪音信號、磷酸化修飾中未修飾片段的中性丟失以及具有相同質(zhì)荷比的修飾后的氨基酸與非修飾氨基酸的區(qū)別等。

此外,在處理磷酸化蛋白質(zhì)樣品質(zhì)譜數(shù)據(jù)時,有必要對修飾位點(diǎn)進(jìn)行假陽性率(false discovery rate,F(xiàn)DR)的控制。對于肽段磷酸位點(diǎn)鑒定來說,可使用質(zhì)量可靠性算法評估磷酸化位點(diǎn)可信度,這種算法主要包括基于概率對鑒定質(zhì)量打分(如建立數(shù)據(jù)模型)和基于假陽性率(如Target-Decoy算法)進(jìn)行計算。對于蛋白磷酸化修飾而言,錯誤定位率(false localization rate,F(xiàn)LR)沒有較好的實現(xiàn)方法,通常是通過合成肽段來評估,或者是針對僅包含一個修飾位點(diǎn)的肽段才有較好的效果。目前,可通過位點(diǎn)定位軟件試圖評估某個給定峰匹配到特定位點(diǎn)的概率,如A-Score算法等;或通過計算兩個修飾位點(diǎn)間的搜索引擎給的打分差值進(jìn)行評估。在選擇這些算法的過程中,要綜合考慮質(zhì)譜平臺檢測的類型、搜庫算法與軟件的便捷性,從而為后續(xù)的分析提供較為可靠的磷酸化位點(diǎn)。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion質(zhì)譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,推出磷酸化定量蛋白組分析服務(wù)技術(shù)包裹。只需要將您的實驗?zāi)康母嬖V我們并寄送樣品,百泰派克生物科技負(fù)責(zé)項目后續(xù),包括蛋白提取、蛋白酶切、磷酸化肽段富集、肽段分離、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析、生物信息學(xué)分析所有事宜。


百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質(zhì)譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(zhì)(包括蛋白質(zhì)、多肽、代謝物)質(zhì)譜分析以及小分子物質(zhì)檢測服務(wù)。


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