檢測技術(shù)服務(wù):IP-MS打質(zhì)譜非特異互作的蛋白一般有哪些--檢測技術(shù)服務(wù)詳情

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免疫沉淀（IP）是研究蛋白質(zhì)相互作用的一種經(jīng)典技術(shù)，而免疫沉淀串聯(lián)質(zhì)譜分析（IP-MS）是目前應(yīng)用zuì廣泛的蛋白相互作用研究方法之一。IP-MS的主要原理是基于特異性抗體或其他親和試劑與靶標(biāo)蛋白的親和作用，通過免疫共沉淀（Co-IP）將靶標(biāo)蛋白與靶標(biāo)蛋白相互作用的蛋白從復(fù)雜的樣本中提取出來，進(jìn)而進(jìn)行質(zhì)譜檢測以鑒定靶標(biāo)蛋白的相互作用蛋白。

通過IP-MS研究蛋白相互作用以及互作蛋白鑒定時，應(yīng)該怎么確定IP-MS打質(zhì)譜非特異互作的蛋白一般有哪些？通常可通過互作蛋白篩選模式進(jìn)行篩選?；プ鞯鞍缀Y選是根據(jù)IP-MS的相對定量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，在IP實驗組中較IP對照組中顯著升高的蛋白即被鑒定為靶標(biāo)蛋白高可信的相互作用蛋白。由于IP實驗的富集原理，IP-MS中顯著差異蛋白的篩選標(biāo)準(zhǔn)相較常規(guī)蛋白質(zhì)組學(xué)通常更高。可以以差異倍數(shù)>10，P value<0.01作為相互作用蛋白的篩選標(biāo)準(zhǔn)。理想的IP-MS實驗會通過特異性靶向目的蛋白以檢測更接近生理狀態(tài)下的蛋白相互作用，但這種檢測準(zhǔn)確性很大程度上會受到目的蛋白內(nèi)源表達(dá)水平低或抗體效價低等因素的干擾。

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