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蛋白的磷酸化和糖基化位點(diǎn)預(yù)測

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關(guān)鍵詞:蛋白磷酸化位點(diǎn)分析,蛋白糖基化位點(diǎn)分析,糖基化位點(diǎn)預(yù)測,蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)檢測,蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué),tmt,抗體測序,itraq,蛋白質(zhì)譜鑒定,蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué),tmt,抗體測序,itraq,蛋白質(zhì)譜鑒定"

蛋白質(zhì)磷酸化和糖基化是常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,能在一定程度上影響蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能,使被修飾的蛋白質(zhì)發(fā)揮特殊的調(diào)控功能。

蛋白磷酸化是在特異性蛋白激酶催化作用下,蛋白氨基酸殘基共價(jià)結(jié)合三磷酸腺苷(ATP)或三磷酸鳥苷(GTP)的過程。該修飾是可逆的,在蛋白磷酸酶的作用下,蛋白質(zhì)可以發(fā)生去磷酸化。

蛋白磷酸化位點(diǎn)分析即鑒定蛋白質(zhì)磷酸化發(fā)生在肽鏈的幾號位氨基酸上以及發(fā)生在何種氨基酸上??赏ㄟ^磷酸酶法、串聯(lián)質(zhì)譜測序法等方法進(jìn)行檢測,其思路大致為將樣品蛋白進(jìn)行酶解,得到肽段混合物,然后特異性識別并富集發(fā)生磷酸化的肽段,再對該肽段的氨基酸序列進(jìn)行分析,找出發(fā)生磷酸化的位點(diǎn)。

蛋白糖基化修飾在真核生物中非常普遍,幾乎有一半以上的蛋白質(zhì)發(fā)生了這種修飾。蛋白糖基化一般發(fā)生在特定位點(diǎn)的氨基酸殘基上,根據(jù)發(fā)生糖基化修飾的氨基酸位點(diǎn)以及結(jié)合的糖鏈類型,可以將糖基化修飾分為N-糖修飾、O-糖修飾以及糖基磷脂酰肌醇錨三類。

蛋白糖基化位點(diǎn)分析主要研究蛋白質(zhì)在哪個(gè)氨基酸位點(diǎn)發(fā)生何種糖基化。其大致的分析策略是先檢測或確定糖蛋白的存在并對其進(jìn)行富集分離;然后利用生物質(zhì)譜結(jié)合蛋白酶或?qū)R恍蕴擒諆?nèi)切酶的作用對收集的糖蛋白進(jìn)行糖基化氨基酸位點(diǎn)鑒定,再將糖基化位點(diǎn)進(jìn)行特異的質(zhì)量標(biāo)記使之與未發(fā)生糖基化的蛋白質(zhì)之間存在一定的質(zhì)量差異,通過質(zhì)譜分析檢測這些差異,進(jìn)而通過串聯(lián)質(zhì)譜鑒定該糖基化修飾發(fā)生的氨基酸位點(diǎn);zuì后進(jìn)行糖鏈結(jié)構(gòu)鑒定以確定發(fā)生的糖基化類型,這是整個(gè)鑒定工作中zuì難zuì復(fù)雜的一步,目前主要采用基質(zhì)輔助激光解吸電離質(zhì)譜(MALDI-TOF-MS)和核磁共振

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