辦理上海食品經營許可證有如下步驟：

一、取得個體工商戶營業(yè)執(zhí)照。辦理健康證和知識培訓合格證，一般可以去醫(yī)院或者當地防疫站辦，**帶上營業(yè)執(zhí)照副本、公章和身份證去。去醫(yī)院體檢后，一般2-3個工作日健康證和知識培訓合格證就可以出來了。

二、準備食品經營許可證申請表，可以向當地市場監(jiān)督管理局咨詢下載地址。

三、準備法人身份證復印件、從業(yè)人員身份證復印件和健康證。然后制定食品安全管理制度（一般當地市場監(jiān)督管理局都有模板）。

四、繪制店鋪的平面圖。提交繳納稅費單據證明，證實你所使用的水是正規(guī)自來水公司提供的。

五、把這些資料全部準備好后，去當地市場監(jiān)督管理局提交（有的地方在政務大廳就可以辦理）。

六、資料提交成功之后，市場監(jiān)督管理局會安排人員來看場地。一般要求為：進貨渠道方有相應的合規(guī)資質，店內衛(wèi)生、使用原料和消毒柜要符合標準。

七、檢查合規(guī)之后一般15-20個工作日食品經營許可證就出來了，很多地方都會打通知去領取。

食品生產經營衛(wèi)生許可證是衛(wèi)生許可證的一個類別之一，是國家衛(wèi)生主管部門對食品生產與經營者頒發(fā)的允許進行食品生產經營的法定證件。在我國，根據《食品衛(wèi)生法》的規(guī)定，食品生產經營企業(yè)和食品商販，必須先取得衛(wèi)生許可證，方可向工商行政管理部門申請登記或者變更登記。衛(wèi)生許可證的發(fā)放管理方法由省、自治區(qū)、直轄市人民政府衛(wèi)生行政部門規(guī)定。衛(wèi)生許可證的發(fā)放適用對象，包括各種供人食用或者飲用的成品和原料以及按照傳統(tǒng)既是食品又是藥品的物品，但是不包括以治療為目的的物品。

1、食品流通許可證申請書；2、負責人、經辦人及食品安全管理人員的身份證復印件（需驗原件）3名稱預先核準通知書復印件。已取得主體資格的經營者申請增加食品經營項目的，提交營業(yè)執(zhí)照副本復印件；4、與食品經營有關的經營設施空間布局圖；5、食品流通單位需配備持B類（食品流通）合格證的食品安全管理員；6、經營場所的使用證明：房產證和房屋租賃合同復印件；7、與食品經營有關的經營設備、工具清單；8、操作流程；9、食品安全管理制度文本；10、特許經營項目流通許可承諾書。
  辦理食品流通許可，一般要經以下步驟：1、咨詢后領取并填寫《食品流通許可申請書》，同時準備相關材料；2、遞交相關文書材料，材料齊全后，領取《接收材料憑證》或《受理通知書》后等待許可核準結果，需要現(xiàn)場核查的配合工商機關現(xiàn)場核查。3、領取《準予許可通知書》，十日內憑通知書領取《食品流通許可證》?；蛑苯宇I取許可證。
具體的你可以去你所在的地區(qū)了解一下具體情況，國家10月1日開始施行新的經營許可管理辦法后，流通證已經被代替了，辦理食品經營許可證就好。